如今，廠房裝修的潔凈室空調潔凈系統所使用的設計方式的種類繁多，其側重點與標準也存在一定差異。。獨立新風系統不負責擔負廠房中的濕負荷，在對各個區域中的潔凈度與溫濕度進行管控時，主要通過各個相互獨立的空調機組實現的。具備獨立新風系統的潔凈室空調系統的優勢主要體現在它能讓整個生產過程一直處在手控狀態。

      為了保證室內的潔凈效果，對空氣循環經過的每一個環節都應加以注意。回風門對氣流雖然為匯流作用，對室內的空氣分布不起主導作用，但是為了迅速有效地排除室內塵粒和微生物，因此回風口宜設在房間下部。這是因為塵粒的跟隨速度和氣流速度相差很小，當其流動方向和塵粒沉降方向一致時，塵粒可以較順利地排向回風口。考慮到生產過程中常會產生污穢物，事后需要清掃及沖洗地板，因此不應設置地板回風，宜在近地面側墻設置回風口。根據規范的規定，潔凈室應采用雙側下部回風。目的是為了盡可能保證送風氣流的二維運動。據實驗顯示，四側回風時，全室平均的亂流度要比兩側回風時大13% 以上，所以對于所有潔凈用房都應采用兩側下回風型式。

      啟用潔凈室后，通常潔凈室會處于正壓狀態，且其密閉性能好，物流與人流通道較為曲折，因此當火災發生時其撲救與疏散難度較大。此外，火源熱量的散發難度較高，故房間內的物品、材料的溫度上升速度較快，很容易增加火災覆蓋面積。潔凈室內的裝修材料及其耐火極限、疏散通道、消防給水、防火閥安置、排風系統防爆、防火策略、自動噴淋等都有嚴格規定。所以，一定要做好防排煙系統的施工工作，尤其要重點關注防排煙的預埋件與布管同專業之間的配合。

      過濾器在潔凈工程中起著非常重要的作用，其過濾效率與生產單元的潔凈級別有著密切的相關性，常規的設計中，普通潔凈級別要求的潔凈室是配備亞高效的過濾器，高潔凈級別的潔凈室配備最高效的過濾器。在本設計中，為了延長末端過濾器的使用時間，潔凈室空調系統使用了三級過濾的方法。